In den einzelnen evangelischen Pfarrgemeinden geschah und geschieht Bildungsarbeit in vielerlei Form. Mit dem Versuch einer Vernetzung begann man in Oberösterreich schon in den 70er-Jahren des vorigen Jahrhunderts und das Ergebnis war die „Arbeitsgemeinschaft Evangelischer Bildungswerke in Oberösterreich“.
1998 wurde seitens der Superintendentur eingeladen, um gemeinsam über die Zukunft der evangelischen Erwachsenenbildung nachzudenken. Als sehr sinnvoll erachtet und einstimmig beschlossen, wurde die Gründung des „Vereins Evangelisches Bildungswerk OÖ“, wobei die Bildungswerke der einzelnen Gemeinden, unter Beibehaltung ihrer Eigenständigkeit, Mitglieder werden konnten. 
Am 20. März 1999 fand die Generalversammlung anlässlich der Vereinskonstituierung des Evangelischen Bildungswerkes Oberösterreich (EBW OÖ) statt. 21 Teilnehmer/innen aus 14 verschiedenen Pfarrgemeinden ( Linz-Innere Stadt, Eferding, Marchtrenk, Gmunden, Gallneukirchen Enns Timelkam, Ried, Thening, Wallern, Rutzenmoos, Lenzing-Kammer, Vöcklabruck), sowie drei weitere Arbeitsbereichen (Frauenarbeit, Evang. Studentenheim Linz, Methodistenkirche) folgten der Einladung. Nach der Anzeige bei der zuständigen Behörde fand die konstituierende Sitzung des Vereins „Evangelisches Bildungswerk Oberösterreich“ am Samstag, 25. September 1999, statt. Bei Vereinsgründung hatten 10 Pfarrgemeinden ein eigenes Bildungswerk, mit Ende 2002 waren es 30, 2004 dann 34 und 38 im Jahr 2018.

Im Februar 2000 wurde dem EBW OÖ das Qualitätssiegel verliehen (Erwachsenen- und Weiterbildung mit Qualitätsgarantie). Nach weiteren Auditierungen in den folgenden Jahren (letzte 2021) ist das Bildungswerk weiterhin berechtigt das Qualitätssiegel zu führen - auch ein Zeichen der qualitätsvollen geleisteten Bildungsarbeit.